חידוש טיפול שורש, או בשמו השני "טיפול שורש חוזר", הוא למעשה חזרה על טיפול השורש המקורי בשן. חידוש טיפול שורש מתבצע כאשר טיפול השורש הראשוני לא צלח מסיבות שנות, כגון חוסר ניקוי ואיטום מספק של השן, תעלה שלא טופלה בטיפול הראשוני, מחסום בתעלת השורש שמנע את הצלחת הטיפול הראשוני, חיידקים עמידים בתעלות השורש, חדירת זיהום לאורך הזמן אל תוך תעלת השורש ועוד.
לעתים אי אפשר לקבוע בוודאות מהו הגורם לחזרת הזיהום או אי היעלמותו לאחר הטיפול הראשוני. אם לא ניתן להגיע להצלחה בחידוש טיפול שורש או שניסיון לחידוש טיפול שורש כרוך בסיכון גבוה של השן, ניתן לשקול אופציה של טיפול מיקרוכירורגי בשורש השן – "אפיסקטומי".
